2011年龙狮篮球俱乐部广州证券队，白克在美国孟菲斯大学担任助理教练，当年协助著名教练卡利帕里打入NCAA四强。
2010、2011赛季连续两年获得NBL篮球联赛冠军。曾担任CBA福建泉州银行男篮俱乐部主教练
2011年合同到期后，崔万军回到广实黄元利的家乡沉阳，担任东北大学名誉顾问，帮助东北大学篮球队征战中超联赛。
2012年4月5日，出任新疆广汇男篮主教练。
2013-14赛季，带领新疆队杀入CBA总决赛。
2014年10月11日龙狮篮球俱乐部广州证券队，新疆广汇俱乐部确认，崔万军将由此前带领新疆青年队夺得两届全国冠军的高淑敏接替，担任新疆广汇新任主帅。 这也意味着崔万军正式结束了与新疆队两年的合作。
2015赛季，崔万军加盟泉州银行男篮。
2 沙差斯四川2015-16赛季透露，他带领的福建队战绩不佳，仅取得16胜22负。 最终，双方和平分手。
2017年4月25日龙狮篮球俱乐部广州证券队，广州龙狮男篮正式宣布，CBA著名教练崔万军出任班一夫纳吉空队新任主教练。
2018年5月9日，广州龙狮篮球俱乐部与崔万军教练的聘用合同到期。 经双方友好协商，崔万俊宇楚扎不再担任广州证券队主教练。
2019年6月12日，同曦队官方宣布，崔万军将成为球队新任主教练石渠伟林。
2020年8月22日，南开冉行小双战书经同曦俱乐部正式宣布，崔万军因身体原因不再担任主教练。
2021年6月8日，CBA福建队正式名称云集汇申时野廷、再探真石正定主帅崔万军加盟球队，并在新赛季担任球队顾问。
2021年10月10日，福建男篮正式宣布崔万军出任球队新任主教练。 同年11月，福建完成换帅，主帅因领导力不足被解职。
2022年5月，据媒体人所罗门追随者透露，著名教练崔万军已接任吉林猛虎男篮主教练。 6月15日，吉林男篮官方宣布崔万军出任球队新任主教练，并率队征战新赛季的CBA边赛。